轻微不良反应
接种乙型流感嗜血杆菌疫苗后，局部反应很常见。接种后 24 小时内，患者可能会感到注射部位疼痛和触痛。这些反应通常是轻微和短暂的。大多数情况下，这些反应会在 2 到 3 天内自行缓解，无需进一步就医（Fritzell 和 Plotki, 1992）。
1992). 接种 Hib 疫苗后很少出现轻微的全身反应，包括发烧（2%）（Valdheim 等人，1990 年）。
严重不良反应
接种 Hib 疫苗后很少发生严重不良反应，因此是目前最安全的疫苗之一。在一项包括 4459 名纳瓦霍族婴儿的研究中，接种 Hib 结合疫苗的婴儿与接种安慰剂的婴儿在严重不良反应的类型和频率上没有差异。研究还表明，Hib 疫苗对艾滋病毒感染者是安全的。
过敏反应
在获准使用前的临床试验中没有过敏反应的报告。此后，在上市后监测中发现了五种可能的过敏反应。不过，尚未有关于接种 Hib 疫苗后出现过敏反应的公开报道。医学研究所在审查现有数据后得出结论：没有足够的证据接受或排除 Hib 疫苗与过敏反应之间的因果关系。
急性发热性多神经炎
尚未开展对照研究来探讨接种 Hib 疫苗后发生急性发热性多神经炎的风险。在获得批准之前的任何临床试验中都没有急性发热性多神经炎的报告。美国医学研究所确认了 7 例接种 Hib 疫苗后出现急性发热性多神经炎的病例，但其中 3 人接种了多种疫苗，1 人发病前的间隔时间过长。因此，医学研究所的结论是，没有足够的证据接受或排除 Hib 疫苗与急性发热性多神经炎之间的因果关系。
血小板缺乏症
在一次 Hib 结合疫苗试验中报告了一例血小板缺乏症；但随后的研究发现疫苗对血小板计数没有影响。此后，上市后监测发现了几例接种 Hib 疫苗后可能出现血小板减少的病例。医学研究所审查了现有数据并得出结论：没有足够的证据接受或排除 Hib 疫苗与血小板减少症之间的因果关系。
横贯性脊髓炎
疫苗不良反应报告系统 (AVRS) 在美国发现了三例接种 Hib 疫苗后可能出现横贯性脊髓炎的病例。但是，文献中没有关于接种 Hib 疫苗后发生横贯性脊髓炎的报道，在批准前的试验中也没有横贯性脊髓炎的病例报道。因此，医学研究所的结论是，没有足够的数据来接受或排除 Hib 疫苗与横贯性脊髓炎之间的因果关系。
人类免疫缺陷病毒感染患者对疫苗的耐受性良好，只有部分患者报告注射部位有轻微疼痛。
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